# 示例 - 单机多Dataset远程Web文件访问加速
通过Alluxio (opens new window)和Fuse (opens new window),Fluid为用户提供了一种更为简单的文件访问接口,使得任意运行在Kubernetes集群上的程序能够像访问本地文件一样轻松访问存储在远程文件系统中的文件。Fluid 针对数据集进行全生命周期的管理和隔离,尤其对于短生命周期应用(e.g 数据分析任务、机器学习任务),用户可以在集群中大规模部署。
本文档通过一个简单的例子演示了上述功能特性
# 前提条件
在运行该示例之前,请参考安装文档完成安装,并检查Fluid各组件正常运行:
$ kubectl get pod -n fluid-system
NAME READY STATUS RESTARTS AGE
alluxioruntime-controller-5b64fdbbb-84pc6 1/1 Running 0 8h
csi-nodeplugin-fluid-fwgjh 2/2 Running 0 8h
csi-nodeplugin-fluid-ll8bq 2/2 Running 0 8h
dataset-controller-5b7848dbbb-n44dj 1/1 Running 0 8h
通常来说,你会看到一个名为dataset-controller
的Pod、一个名为alluxioruntime-controller
的Pod和多个名为csi-nodeplugin
的Pod正在运行。其中,csi-nodeplugin
这些Pod的数量取决于你的Kubernetes集群中结点的数量。
# 运行示例
对某个节点打标签
$ kubectl label node cn-beijing.192.168.0.199 fluid=multi-dataset
在接下来的步骤中,我们将使用
NodeSelector
来管理Dataset调度的节点,这里仅做试验使用。
查看待创建的Dataset资源对象
$ cat<<EOF >dataset.yaml
apiVersion: data.fluid.io/v1alpha1
kind: Dataset
metadata:
name: hbase
spec:
mounts:
- mountPoint: https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/apache/hbase/stable/
name: hbase
nodeAffinity:
required:
nodeSelectorTerms:
- matchExpressions:
- key: fluid
operator: In
values:
- "multi-dataset"
placement: "Shared" // 设置为 Exclusive 或者为空则为独占节点数据集
EOF
$ cat<<EOF >dataset1.yaml
apiVersion: data.fluid.io/v1alpha1
kind: Dataset
metadata:
name: spark
spec:
mounts:
- mountPoint: https://mirrors.bit.edu.cn/apache/spark/
name: spark
nodeAffinity:
required:
nodeSelectorTerms:
- matchExpressions:
- key: fluid
operator: In
values:
- "multi-dataset"
placement: "Shared"
EOF
注意: 上述mountPoint中使用了Apache清华镜像源进行演示,如果你的环境位于海外,请更换为
https://downloads.apache.org/hbase/stable/
和https://downloads.apache.org/spark/
进行尝试
在这里,我们将要创建一个kind为Dataset
的资源对象(Resource object)。Dataset
是Fluid所定义的一个Custom Resource Definition(CRD),该CRD被用来告知Fluid在哪里可以找到你所需要的数据。Fluid将该CRD对象中定义的mountPoint
属性挂载到Alluxio之上,因此该属性可以是任何合法的能够被Alluxio识别的UFS地址。在本示例中,为了简单,我们使用WebUFS (opens new window)进行演示。
更多有关UFS的信息,请参考Alluxio文档-底层存储系统 (opens new window)部分。
本示例将以Apache镜像站点上的Hbase stable和Spark相关资源作为演示中使用的远程文件。这个选择并没有任何特殊之处,你可以将这个远程文件修改为任意你喜欢的远程文件。但是,如果你想要和我们一样使用WebUFS进行操作的话,最好还是选择一个Apache镜像源站点( e.g. 清华镜像源 (opens new window) ),因为根据目前WebUFS的实现,如果你选择其他更加复杂的网页作为WebUFS,你可能需要进行更多更复杂的配置 (opens new window)
创建Dataset资源对象
$ kubectl apply -f dataset.yaml
dataset.data.fluid.io/hbase created
$ kubectl apply -f dataset1.yaml
dataset.data.fluid.io/spark created
查看Dataset资源对象状态
$ kubectl get dataset
NAME UFS TOTAL SIZE CACHED CACHE CAPACITY CACHED PERCENTAGE PHASE AGE
hbase NotBound 6s
spark NotBound 4s
如上所示,status
中的phase
属性值为NotBound
,这意味着该Dataset
资源对象目前还未与任何AlluxioRuntime
资源对象绑定,接下来,我们将创建一个AlluxioRuntime
资源对象。
查看待创建的AlluxioRuntime资源对象
$ cat<<EOF >runtime.yaml
apiVersion: data.fluid.io/v1alpha1
kind: AlluxioRuntime
metadata:
name: hbase
spec:
replicas: 1
tieredstore:
levels:
- mediumtype: MEM
path: /dev/shm
quota: 2Gi
high: "0.95"
low: "0.7"
EOF
$ cat<<EOF >runtime1.yaml
apiVersion: data.fluid.io/v1alpha1
kind: AlluxioRuntime
metadata:
name: spark
spec:
replicas: 1
tieredstore:
levels:
- mediumtype: MEM
path: /dev/shm
quota: 4Gi
high: "0.95"
low: "0.7"
EOF
创建AlluxioRuntime资源对象
$ kubectl create -f runtime.yaml
alluxioruntime.data.fluid.io/hbase created
# 注意等待 Dataset hbase 全部组件 Running
$ kubectl get pod -o wide | grep hbase
NAME READY STATUS RESTARTS AGE IP NODE NOMINATED NODE READINESS GATES
hbase-fuse-jl2g2 1/1 Running 0 2m24s 192.168.0.199 cn-beijing.192.168.0.199 <none> <none>
hbase-master-0 2/2 Running 0 2m55s 192.168.0.200 cn-beijing.192.168.0.200 <none> <none>
hbase-worker-g89p8 2/2 Running 0 2m24s 192.168.0.199 cn-beijing.192.168.0.199 <none> <none>
$ kubectl create -f runtime1.yaml
alluxioruntime.data.fluid.io/spark created
检查AlluxioRuntime资源对象是否已经创建
$ kubectl get alluxioruntime
NAME MASTER PHASE WORKER PHASE FUSE PHASE AGE
hbase Ready Ready Ready 2m14s
spark Ready Ready Ready 58s
AlluxioRuntime
是另一个Fluid定义的CRD。一个AlluxioRuntime
资源对象描述了在Kubernetes集群中运行一个Alluxio实例所需要的配置信息。
等待一段时间,让AlluxioRuntime资源对象中的各个组件得以顺利启动,你会看到类似以下状态:
$ kubectl get pod -o wide
NAME READY STATUS RESTARTS AGE IP NODE NOMINATED NODE READINESS GATES
hbase-fuse-jl2g2 1/1 Running 0 2m24s 192.168.0.199 cn-beijing.192.168.0.199 <none> <none>
hbase-master-0 2/2 Running 0 2m55s 192.168.0.200 cn-beijing.192.168.0.200 <none> <none>
hbase-worker-g89p8 2/2 Running 0 2m24s 192.168.0.199 cn-beijing.192.168.0.199 <none> <none>
spark-fuse-5z49p 1/1 Running 0 19s 192.168.0.199 cn-beijing.192.168.0.199 <none> <none>
spark-master-0 2/2 Running 0 50s 192.168.0.200 cn-beijing.192.168.0.200 <none> <none>
spark-worker-96ksn 2/2 Running 0 19s 192.168.0.199 cn-beijing.192.168.0.199 <none> <none>
注意上面的不同的 Dataset 的 worker 和 fuse 组件可以正常的调度到相同的节点 cn-beijing.192.168.0.199
。
再次查看Dataset资源对象状态
$ kubectl get dataset
NAME UFS TOTAL SIZE CACHED CACHE CAPACITY CACHED PERCENTAGE PHASE AGE
hbase 443.89MiB 0.00B 2.00GiB 0.0% Bound 11m
spark 1.92GiB 0.00B 4.00GiB 0.0% Bound 9m38s
因为已经与一个成功启动的AlluxioRuntime绑定,该Dataset资源对象的状态得到了更新,此时PHASE
属性值已经变为Bound
状态。通过上述命令可以获知有关资源对象的基本信息
查看AlluxioRuntime状态
$ kubectl get alluxioruntime -o wide
NAME READY MASTERS DESIRED MASTERS MASTER PHASE READY WORKERS DESIRED WORKERS WORKER PHASE READY FUSES DESIRED FUSES FUSE PHASE AGE
hbase 1 1 Ready 1 1 Ready 1 1 Ready 11m
spark 1 1 Ready 1 1 Ready 1 1 Ready 9m52s
AlluxioRuntime
资源对象的status
中包含了更多更详细的信息
查看与远程文件关联的PersistentVolume以及PersistentVolumeClaim
$ kubectl get pv
NAME CAPACITY ACCESS MODES RECLAIM POLICY STATUS CLAIM STORAGECLASS REASON AGE
hbase 100Gi RWX Retain Bound default/hbase 4m55s
spark 100Gi RWX Retain Bound default/spark 51s
$ kubectl get pvc
NAME STATUS VOLUME CAPACITY ACCESS MODES STORAGECLASS AGE
hbase Bound hbase 100Gi RWX 4m57s
spark Bound spark 100Gi RWX 53s
Dataset
资源对象准备完成后(即与Alluxio实例绑定后),与该资源对象关联的PV, PVC已经由Fluid生成,应用可以通过该PVC完成远程文件在Pod中的挂载,并通过挂载目录实现远程文件访问
# 远程文件访问
查看待创建的应用
$ cat<<EOF >nginx.yaml
apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
name: nginx-hbase
spec:
containers:
- name: nginx
image: nginx
volumeMounts:
- mountPath: /data
name: hbase-vol
volumes:
- name: hbase-vol
persistentVolumeClaim:
claimName: hbase
nodeName: cn-beijing.192.168.0.199
EOF
$ cat<<EOF >nginx1.yaml
apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
name: nginx-spark
spec:
containers:
- name: nginx
image: nginx
volumeMounts:
- mountPath: /data
name: hbase-vol
volumes:
- name: hbase-vol
persistentVolumeClaim:
claimName: spark
nodeName: cn-beijing.192.168.0.199
EOF
启动应用进行远程文件访问
$ kubectl create -f nginx.yaml
$ kubectl create -f nginx1.yaml
登录Nginx hbase Pod:
$ kubectl exec -it nginx-hbase -- bash
查看远程文件挂载情况:
$ ls -lh /data/hbase
total 444M
-r--r----- 1 root root 193K Sep 16 00:53 CHANGES.md
-r--r----- 1 root root 112K Sep 16 00:53 RELEASENOTES.md
-r--r----- 1 root root 26K Sep 16 00:53 api_compare_2.2.6RC2_to_2.2.5.html
-r--r----- 1 root root 211M Sep 16 00:53 hbase-2.2.6-bin.tar.gz
-r--r----- 1 root root 200M Sep 16 00:53 hbase-2.2.6-client-bin.tar.gz
-r--r----- 1 root root 34M Sep 16 00:53 hbase-2.2.6-src.tar.gz
登录Nginx spark Pod:
$ kubectl exec -it nginx-spark -- bash
查看远程文件挂载情况:
$ ls -lh /data/spark/
total 1.0K
dr--r----- 1 root root 7 Oct 22 12:21 spark-2.4.7
dr--r----- 1 root root 7 Oct 22 12:21 spark-3.0.1
$ du -h /data/spark/
999M /data/spark/spark-3.0.1
968M /data/spark/spark-2.4.7
2.0G /data/spark/
登出Nginx Pod:
$ exit
正如你所见,WebUFS上所存储的全部文件,可以和本地文件完全没有区别的方式存在于某个Pod中,并且可以被该Pod十分方便地访问
# 远程文件访问加速
为了演示在访问远程文件时,你能获得多大的加速效果,我们提供了一个测试作业的样例:
查看待创建的测试作业
$ cat<<EOF >app.yaml
apiVersion: batch/v1
kind: Job
metadata:
name: fluid-copy-test-hbase
spec:
template:
spec:
restartPolicy: OnFailure
containers:
- name: busybox
image: busybox
command: ["/bin/sh"]
args: ["-c", "set -x; time cp -r /data/hbase ./"]
volumeMounts:
- mountPath: /data
name: hbase-vol
volumes:
- name: hbase-vol
persistentVolumeClaim:
claimName: hbase
nodeName: cn-beijing.192.168.0.199
EOF
$ cat<<EOF >app1.yaml
apiVersion: batch/v1
kind: Job
metadata:
name: fluid-copy-test-spark
spec:
template:
spec:
restartPolicy: OnFailure
containers:
- name: busybox
image: busybox
command: ["/bin/sh"]
args: ["-c", "set -x; time cp -r /data/spark ./"]
volumeMounts:
- mountPath: /data
name: spark-vol
volumes:
- name: spark-vol
persistentVolumeClaim:
claimName: spark
nodeName: cn-beijing.192.168.0.199
EOF
启动测试作业
$ kubectl create -f app.yaml
job.batch/fluid-copy-test-hbase created
$ kubectl create -f app1.yaml
job.batch/fluid-copy-test-spark created
hbase任务程序会执行time cp -r /data/hbase ./
的shell命令,其中/data/hbase
是远程文件在Pod中挂载的位置,该命令完成后会在终端显示命令执行的时长。
spark任务程序会执行time cp -r /data/spark ./
的shell命令,其中/data/spark
是远程文件在Pod中挂载的位置,该命令完成后会在终端显示命令执行的时长。
等待一段时间,待该作业运行完成,作业的运行状态可通过以下命令查看:
$ kubectl get pod -o wide | grep copy
fluid-copy-test-hbase-r8gxp 0/1 Completed 0 4m16s 172.29.0.135 cn-beijing.192.168.0.199 <none> <none>
fluid-copy-test-spark-54q8m 0/1 Completed 0 4m14s 172.29.0.136 cn-beijing.192.168.0.199 <none> <none>
如果看到如上结果,则说明该作业已经运行完成
注意:
fluid-copy-test-hbase-r8gxp
中的r8gxp
为作业生成的标识,在你的环境中,这个标识可能不同,接下来的命令中涉及该标识的地方请以你的环境为准
查看测试作业完成时间
$ kubectl logs fluid-copy-test-hbase-r8gxp
+ time cp -r /data/hbase ./
real 3m 34.08s
user 0m 0.00s
sys 0m 1.24s
$ kubectl logs fluid-copy-test-spark-54q8m
+ time cp -r /data/spark ./
real 3m 25.47s
user 0m 0.00s
sys 0m 5.48s
可见,第一次远程文件的读取hbase耗费了接3m34s的时间,读取spark耗费接近3m25s时间。
查看Dataset资源对象状态
$ kubectl get dataset
NAME UFS TOTAL SIZE CACHED CACHE CAPACITY CACHED PERCENTAGE PHASE AGE
hbase 443.89MiB 443.89MiB 2.00GiB 100.0% Bound 30m
spark 1.92GiB 1.92GiB 4.00GiB 100.0% Bound 28m
现在,所有远程文件都已经被缓存在了Alluxio中
再次启动测试作业
$ kubectl delete -f app.yaml
$ kubectl create -f app.yaml
$ kubectl delete -f app1.yaml
$ kubectl create -f app1.yaml
由于远程文件已经被缓存,此次测试作业能够迅速完成:
$ kubectl get pod -o wide| grep fluid
fluid-copy-test-hbase-sf5md 0/1 Completed 0 53s 172.29.0.137 cn-beijing.192.168.0.199 <none> <none>
fluid-copy-test-spark-fwp57 0/1 Completed 0 51s 172.29.0.138 cn-beijing.192.168.0.199 <none> <none>
$ kubectl logs fluid-copy-test-hbase-sf5md
+ time cp -r /data/hbase ./
real 0m 0.36s
user 0m 0.00s
sys 0m 0.36s
$ kubectl logs fluid-copy-test-spark-fwp57
+ time cp -r /data/spark ./
real 0m 1.57s
user 0m 0.00s
sys 0m 1.57s
同样的文件访问操,hbase仅耗费了0.36s,spark仅耗费了1.57s。
这种大幅度的加速效果归因于Alluxio所提供的强大的缓存能力,这种缓存能力意味着,只要你访问某个远程文件一次,该文件就会被缓存在Alluxio中,你的所有接下来的重复访问都不再需要进行远程文件读取,而是从Alluxio中直接获取数据,因此对于数据的访问加速也就不难解释了。
注意: 上述文件的访问速度与示例运行环境的网络条件有关,如果文件访问速度过慢,请更换更小的远程文件尝试
同样登录主机节点(如果可以)
$ ssh root@192.168.0.199
$ ls /dev/shm/default/
hbase spark
$ ls -lh /dev/shm/default/hbase/alluxioworker/
总用量 444M
-rwxrwxrwx 1 root root 174K 10月 22 20:27 100663296
-rwxrwxrwx 1 root root 115K 10月 22 20:27 16777216
-rwxrwxrwx 1 root root 200M 10月 22 20:26 33554432
-rwxrwxrwx 1 root root 106K 10月 22 20:26 50331648
-rwxrwxrwx 1 root root 211M 10月 22 20:27 67108864
-rwxrwxrwx 1 root root 34M 10月 22 20:27 83886080
$ ls -lh /dev/shm/default/spark/alluxioworker/
总用量 2.0G
-rwxrwxrwx 1 root root 210M 10月 22 21:06 100663296
-rwxrwxrwx 1 root root 16M 10月 22 21:07 117440512
-rwxrwxrwx 1 root root 195M 10月 22 21:05 134217728
-rwxrwxrwx 1 root root 214M 10月 22 21:05 150994944
-rwxrwxrwx 1 root root 140M 10月 22 21:08 16777216
-rwxrwxrwx 1 root root 22M 10月 22 21:05 167772160
-rwxrwxrwx 1 root root 221M 10月 22 21:07 184549376
-rwxrwxrwx 1 root root 150M 10月 22 21:06 201326592
-rwxrwxrwx 1 root root 311K 10月 22 21:07 218103808
-rwxrwxrwx 1 root root 322K 10月 22 21:06 234881024
-rwxrwxrwx 1 root root 210M 10月 22 21:06 33554432
-rwxrwxrwx 1 root root 161M 10月 22 21:07 50331648
-rwxrwxrwx 1 root root 223M 10月 22 21:07 67108864
-rwxrwxrwx 1 root root 208M 10月 22 21:07 83886080
可以看到不同Dataset缓存的block文件根据Dataset的namespace和name进行了隔离。
# 环境清理
$ kubectl delete -f .
$ kubectl label node cn-beijing.192.168.0.199 fluid-